用户的贷款逾期被起诉是不会有案底的。贷款逾期通常属于民事诉讼，民事诉讼不会留下案底，只有刑事诉讼才会留下刑事案底。除非用户存在恶意逾期、骗贷的情况，那么才会有可能被提起刑事诉讼，不然大部分时候，贷款机构或者银行起诉用户都属于民事诉讼。而且起诉后，法院会介入先让双方进行协商，协商成功后，银行或者贷款机构会撤诉，这样对于用户就不会产生更加严重的负面影响。而双方协商失败后，才会由法院来判决，法院判决也是让用户还款，只要用户愿意还款，那么双方基本上可以协商成功。另外，用户在贷款逾期后，只要尽快还款，那么贷款机构就不会起诉用户。毕竟起诉也需要一定的成本，可以通过催收拿回欠款，贷款机构也是不愿意起诉的。